Buenas a ver yo he echo algo con la api de javax.mail, puedes conectarte a cualquier correo en formato pop3 o imap y descargar los correos, tambien puedes configurar una pasarela aunque no estoy muy puesto en este tema pues la administracion no es muy fuerte.
Aqui donde trabajo los servidores son exchange pero aun hay buzones notes (vamos lo tienen al contrario de como tu requieres, vamos los servidores de correo notes siguen funcionando pero a modo de pasarelas es lo unico que se, el problema de esto viene con los formatos de los correos y codificacion de caracteres.