Hola Antonio, como dice Miguel Angel podría ser un problema de red, pero yo creo que antes de meterte en "fregaos" deberías hacer un buen "problem determination", desde luego saber la hora exasta cuando se produce el problema te da mucha ventaja, te cuento lo que yo haría:

A las doce menos cinco me sentaría delante de una pantalla del sistema y haría un WRKACTJOB, me situaría en el subsystema donde cuelgan los jobs (tareas para los de los sistemas inestables) para ver que porcentaje de utilización está teniendo cada job, ya sabes F10 para reiniciar estadísticas y F5 para refrescar. Hay alguna tarea que se está desmadrando ??? vete dando F5 para ver si algún job se está "quedando con la máquina".

Aparentemente tu servidor (Domino) se queda frito a las doce, tienes algún trabajo planicifado e esa hora ??? ya sabes WRKJOBSCDE (trabajar con entradas del planificador del sistema) y mira a ver si tienes algo raro a esa hora.

Desconfías de alguna tarea ??? una actualización de índices a lo bestia y, por ejemplo, la tarea Design te puede dejar crujido el servidor pero eso lo verás con el WRKACTJOB.

Sospechas de la red ??? para eso en tu sistema tiene varias opciones para tratar de acotar el problema, pero habría que saber como tienes configurada tu máquina. Tienes un interface exclusivo para Domino o lo compartes con el resto de conexiones ??? (Telnet, impresoras, acesso a base de datos, etc). Una prueba buena (siempre que tengas claro que tu problema está en la red) sería hacer que Domino escuche por otra tarjeta de red.

A bote pronto yo haría un NETSTAT, opción 3, busca las conexiones con el puerto 1352 y mira si el contador de retramisones se incrementa mucho a la hora del problema.

Te pongo un enlace a mi blog donde cuento como funciona esto de las retrasmisiones, el tema es sobre sesiones Telnet pero te vale para que entiendas de que te estoy hablando.

http://www.sidra400.com/sidra400.nsf/dx/sesiones-5250-%C2%A1%C2%A1%C2%A1-please-help-%C2%A1%C2%A1%C2%A1

Un saludo y suerte