Gracias por los comentarios. Descarto problema de red, porque otras aplicaciones que utilizan red si funcionan correctamente. Lo que me surge duda es si hay algun otro trabajo que no he encontrado en Lotus, se active a esa hora y hace que se vuelva lento.
El performance del Iseries no tiene problemas, incluso el % de CPU sube máximo 5 puntos, lo único que he visto es que el trabajo ADMINP utiliza más CPU en ese momento, pero no se logran ver que ejecuta en ese momento, al parecer ese detalle no se logra visualizar en el Iseries, tendo duda si en alguna parte del Lotus Administrator pueda encontrar alguna información detallada de lo que se inicia a ejecutar en el Domino.