Los controles upload se pueden "diseñar" con CSS, y si quieres que funcionen en un Ipad, tendras que tener la version 6.x de iOS y ademas solo podras subir imagenes del carrete o tomar una foto, no documentos.
http://stackoverflow.com/questions/3891831/a-html5-web-app-for-mobile-safari-to-upload-images-from-the-photos-app