Hola Alejandro.
Por defecto la base de datos se purga a los 30 dias. Este valor se establece en los parametros de Replicacion de la base de datos DATA\mtdata\mtstore.nsf
Pero ten presente que si tienes mucho trafico de correo, incluso esa cifra de 30 dias puede perjudicar el rendimiento, asi que no quiero ni pensar en dos años.
Yo que tu haria backup periodicamente de la NSF por si llegado el momento tienes que crearla de 0 asi tendras un "historico"
Un Saludo